2024精选客户服务案例 | Cell领衔，50+署名/致谢文章，谱度众合spec-ally 与您共谱发展新篇
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时间：2025-02-08
回首过去的2024年，谱度众合spec-ally 凭借卓越的技术和优质的服务，与广大客户携手并进，在充满挑战与机遇的临床蛋白质组学领域，共同谱写了合作共赢的辉煌篇章。据不完全统计，2024年，署名/致谢谱度众合spec-ally 的客户文章数量突破50篇，累计影响因子高达478，其中包括Cell 1篇、Autophagy 4篇、Cancer Communications 2篇、Nucleic Acids Research 1篇、Nature Communications 1篇等高水平期刊，影响因子10分以上的合作文章更是高达18篇。这些成果不仅彰显了我们在蛋白质组学领域的专业实力，更体现了客户对谱度众合spec-ally 的高度信任与认可。
接下来，我们将为您呈现2024年谱度众合spec-ally 最具代表性的10大客户服务案例。这些案例涵盖了多个研究领域，并运用了包括DIA、IP-MS、LiP-MS、AP-MS等多种前沿蛋白质组学技术，充分展现了蛋白质组学在生命科学研究中的广泛应用与巨大潜力。我们希望通过这些案例，为您的科研工作提供新的思路与启发。未来，谱度众合spec-ally 将继续秉持创新精神，深耕技术研发，优化服务体系，与您携手探索科学前沿，共同推动生命科学领域的进步与发展！
免疫领域
客户文章1：裂谷热病毒非结构蛋白NSs促进病毒感染的机制
英文标题：Rift Valley fever virus coordinates the assembly of a programmable E3 ligase to promote viral replication
发表期刊：Cell
影响因子：45.5
发表时间：2024年
客户单位：中国科学院武汉病毒研究所
服务产品：IP-MS蛋白互作组研究学解决方案-动态互作组学
研究领域：免疫
文章链接：
https://doi.org/10.1016/j.cell.2024.09.008
本研究通过免疫沉淀-质谱联用技术（IP-MS）鉴定了与NSs相互作用的宿主蛋白，找到了关键互作蛋白E3泛素蛋白连接酶（FBXO3）。该结果为进一步揭示RVFV利用宿主的泛素-蛋白酶体系统来降解关键的细胞蛋白从而促进病毒复制的致病新机制提供了关键线索。该研究揭示了裂谷热病毒（RVFV）的非结构蛋白NSs通过形成纤维状E3连接酶来触发目标蛋白有效降解的致病机制。提供了NSs纤维状结构形成的高分辨率结构细节，并揭示了其促进RVFV发病的分子机制。该结果为开发靶向NSs蛋白的特异性抗RVFV药物提供了重要参考。
实验流程图及生信分析图
肿瘤领域
客户文章2：EB病毒编码的潜伏膜蛋白1在鼻咽癌免疫逃逸中的作用
英文标题：Targeting the LMP1-ALIX axis in EBV+ nasopharyngeal carcinoma inhibits immunosuppressive small extracellular vesicle secretion and boosts anti-tumor immunity
发表期刊：Cancer Communications
影响因子：20.1
发表时间：2024年
客户单位：武汉大学中南医院
服务产品：IP-MS蛋白互作组学解决方案
研究领域：鼻咽癌
文章链接：
https://doi.org/10.1002/cac2.12619
本文通过免疫沉淀质谱联用技术（IP-MS）鉴定了与EB病毒编码的潜伏膜蛋白1（LMP1）相互作用的蛋白质，特别是ALIX（Apoptosis-linked gene 2-interacting protein X）。这一发现揭示了LMP1通过调控小细胞外囊泡（sEVs）中PD-L1的分泌，在鼻咽癌免疫逃逸中的关键作用。研究阐明了LMP1与ALIX和PD-L1形成三分子复合物的机制，其中LMP1的细胞内结构域与ALIX的PRR（Proline-Rich Region）结构域相互作用，而其跨膜结构域则与PD-L1结合，从而促进PD-L1加载到ALIX依赖的sEVs中。这一机制为后续的功能研究和分子机制探索提供了重要的理论基础。
IP-MS质谱图及分子对接图
客户文章3：NAT10介导的ac4C在肝细胞癌进展中的作用
英文标题：Targeting N4-acetylcytidine suppresses hepatocellular carcinoma progression by repressing eEF2-mediated HMGB2 mRNA translation
发表期刊：Cancer Communications
影响因子：20.1
发表时间：2024年
客户单位：华中科技大学同济医学院附属同济医院
服务产品：基于IP-DIA技术的定量蛋白质组学分析
研究领域：肿瘤
文章链接：
https://doi.org/10.1002/cac2.12595
本文通过数据非依赖性采集（DIA）蛋白质组学技术，发现了123个蛋白质与ac4C修饰的RNA有显著的相互作用，这些蛋白可能参与调控mRNA的翻译过程。该结果为揭示NAT10介导的ac4C修饰如何调控mRNA翻译的分子机制提供了重要线索。本研究探讨了N4-乙酰胞嘧啶（ac4C）这一新型mRNA修饰及其相关乙酰转移酶N-乙酰转移酶10（NAT10）在肝细胞癌（HCC）发展和预后中的作用。研究发现，NAT10介导的ac4C修饰能够促进HCC的进展，还鉴定了Panobinostat作为强效抑制剂，显著抑制HCC细胞的增殖、迁移和体内肿瘤生长。该研究成果为HCC治疗提供了新的潜在治疗策略。
质谱实验流程图
客户文章4：ATL-I在透明细胞肾细胞癌中的抗肿瘤和抗血管生成作用及其机制
英文标题：Atractylenolide I inhibits angiogenesis and reverses sunitinib resistance in clear cell renal cell carcinoma through ATP6V0D2-mediated autophagic degradation of EPAS1/HIF2α
发表期刊：Autophagy
影响因子：14.6
发表时间：2024年
客户单位：华中科技大学同济医学院附属同济医院
服务产品：蛋白互作组学解决方案
研究领域：透明细胞肾细胞癌
文章链接：
https://doi.org/10.1080/15548627.2024.2421699
本研究通过免疫共沉淀-质谱联用技术（CoIP-MS）成功鉴定了 ATP6V0D2 的主要结合蛋白 RAB7 和 VPS41，揭示了它们在自噬体-溶酶体融合中的关键作用。研究发现，ATL-I 通过上调 ATP6V0D2，促进 EPAS1/HIF2α 的自噬降解，从而抑制 ccRCC 的肿瘤生长和血管生成，并有效逆转 舒尼替尼 的耐药性。这些发现表明，ATL-I 具有显著的临床应用潜力，可作为 ccRCC 治疗的候选药物，尤其为舒尼替尼耐药患者提供了新的治疗策略。
人工靶向酶领域
客户文章5：人工G4靶向生物素连接酶用于在活细胞中识别与G-四链体相互作用的蛋白质
英文标题：Identification of G-quadruplex-interacting proteins in living cells using an artificial G4-targeting biotin ligase
发表期刊：Nucleic Acids Research
影响因子：16.6
发表时间：2024年
客户单位：武汉大学
服务产品：基于DIA的非标记定量蛋白组学服务
研究领域：人工靶向生物素连接酶
文章链接：
https://doi.org/10.1093/nar/gkae126
本文开发了一种名为G4PID的人工G4靶向生物素连接酶，结合邻近标记技术（PLGPB），利用无标记定量蛋白质组学和DIA模式的LC-MS/MS技术，成功在活细胞中鉴定了149种与G-四链体（G4）相互作用的蛋白质。通过体外和体内实验，研究验证了G4PID对G4结构的特异性结合和标记能力，并发现剪接因子SF3B4优先结合富含G4的RNA剪接位点，调控mRNA剪接过程。该研究不仅扩展了G4相互作用蛋白的数据库，还揭示了G4结构在RNA剪接中的调控作用，为深入理解G4的生物学功能提供了新的视角和方法。
实验流程图
植物领域
客户文章6：ERD15La蛋白协调RxLR23蛋白来调节NbNAC68蛋白触发的植物免疫
英文标题：A conserved oomycete effector RxLR23 triggers plant defense responses by targeting ERD15La to release NbNAC68
发表期刊：Nature Communications
影响因子：14.7
发表时间：2024年
客户单位：山东农业大学植物保护学院
服务产品：蛋白互作组学解决方案
研究领域：植物防御反应
文章链接：
https://doi.org/10.1038/s41467-024-50782-3
本研究通过免疫共沉淀-质谱联用技术（CoIP-MS）成功鉴定了三种与NbERD15La有潜在相互作用且含有假定的NAC结构域蛋白68的蛋白质NbNAC68a、NbNAC68b和NbNAC68c，并在后续实验中进行了验证，为研究辣椒疫霉的RxLR效应子的功能奠定了基础。研究发现一种植物防御反应策略:辣椒疫霉的效应子RxLR23KM能够诱导植物细胞死亡和植物免疫反应。通过结合ERD15La，释放促进植物免疫的NbNAC68，从而激活植物免疫。该研究增进了我们对植物病原体效应子如何操纵宿主免疫反应的理解，而且为开发新的植物病害防治策略提供了潜在的靶点。
生物作用验证图
蛋白质稳态领域
客户文章7：PLK2介导SQSTM1 S349磷酸化使多聚泛素化蛋白聚集
英文标题：PLK2-mediated phosphorylation of SQSTM1 S349 promotes aggregation of polyubiquitinated proteins upon proteasomal dysfunction
发表期刊：Autophagy
影响因子：14.6
发表时间：2024年
客户单位：武汉大学中南医院
服务产品：蛋白互作组研究解决方案
研究领域：蛋白质稳态
文章链接：
https://doi.org/10.1080/15548627.2024.2361574
本研究采用无标记定量质谱技术（label-free quantitative MS, LFQ）对PLK2的相互作用蛋白进行了系统鉴定和定量分析，鉴定了与PLK2相互作用的蛋白质，找到了关键互作蛋白SQSTM1。该结果对于揭示PLK2在细胞内的复杂功能和信号传导途径具有重要价值，为PLK2在调节SQSTM1介导的多泛素化蛋白聚集中的作用提供了关键线索。蛋白质稳态的失调会导致蛋白质聚集体的积累，这些聚集体会被隔离到包涵体或聚集体中，通过不同机制进行清除以降低蛋白质毒性，清除方式包括由自噬受体SQSTM1介导的聚集体自噬。该研究鉴定了PLK2为SQSTM1介导的多泛素化蛋白聚集的重要调节因子，并揭示了PLK2介导的SQSTM1 S349磷酸化是SQSTM1介导的多泛素化蛋白聚集的一个关键调控机制。这些发现为理解蛋白质稳态的维持和相关的疾病提供了重要的机制见解。
生物作用验证图
肾脏疾病领域
客户文章8：神经氨酸酶4（NEU4）在肾纤维化中的作用
英文标题：Targeting Neuraminidase 4 Attenuates Kidney Fibrosis in Mice
发表期刊：Advanced Science
影响因子：14.3
发表时间：2024年
客户单位：中国药科大学
服务产品：IP-MS蛋白互作组学解决方案
研究领域：肾纤维化
文章链接：https://doi.org/10.1002/advs.202406936
本文通过IP-MS蛋白互作组学解决方案鉴定了NEU4与YAP蛋白之间的相互作用并进一步确定了NEU4与YAP相互作用的具体区域，即NEU4的254-388氨基酸区域与YAP的WW2结构域（231-263氨基酸区域）之间的直接结合。该结果为揭示NEU4在肾脏纤维化中的作用机制和寻找新的治疗靶点提供了重要线索。该研究揭示了神经氨酸酶4（NEU4）在小鼠肾脏纤维化中的作用机制。NEU4与Yes相关蛋白（YAP）在WW2结构域（231-263aa）相互作用，促进其核转位和靶基因的激活，从而促进肾脏纤维化。研究还发现了一种新的NEU4抑制剂3,5,6,7,8,3',4'-七甲氧基黄酮（HMF），它能够有效地保护小鼠免受肾脏纤维化。该研究表明NEU4是肾脏纤维化治疗的一个潜在靶点。
质谱图
药物筛选领域
客户文章9：双嘧达莫作为新型铁死亡抑制剂在急性呼吸窘迫综合征治疗中的潜力
英文标题：Characterization of dipyridamole as a novel ferroptosis inhibitor and its therapeutic potential in acute respiratory distress syndrome management
发表期刊：Theranostics
影响因子：12.4
发表时间：2024年
客户单位：安徽医科大学
服务产品：LiP-MS药物靶点筛选解决方案
研究领域：药物筛选
文章链接：https://doi.org/10.7150/thno.102318
本文通过有限蛋白酶解-质谱法（LiP-MS）成功发现了双嘧达莫（DIPY）与超氧化物歧化酶1（SOD1）之间的直接相互作用，揭示了DIPY通过直接结合和激活SOD1，进而抑制CREB1/HMOX1途径，从而抑制铁死亡的分子机制。该结果对于鉴定药物作用靶点与揭示药物作用机制具有重要意义。该研究从259种FDA批准药物中筛选出了铁死亡的有效抑制剂双嘧达莫（DIPY），研究发现，DIPY在两种ARDS小鼠模型（LPS诱导的急性肺损伤和CLP诱导的败血症）和人类气道类器官（hAOs）中有效减轻了铁死亡和肺损伤，并在临床试验中证明了DIPY辅助治疗能够改善ARDS患者的预后。该研究成果为ARDS的治疗提供了新的策略。
LiP-MS实验流程图
毒性作用领域
客户文章10：聚苯乙烯纳米塑料对斑马鱼幼虫肠道健康和糖脂代谢的影响
英文标题：Interactions between intestinal microbiota and metabolites in zebrafish larvae exposed to polystyrene nanoplastics: Implications for intestinal health and glycolipid metabolism
发表期刊：Journal of Hazardous Materials
影响因子：12.2
发表时间：2024年
客户单位：湖北中医药大学基础医学院
服务产品：非标记定量蛋白组学服务
研究领域：毒性作用
文章链接：https://doi.org/10.1016/j.jhazmat.2024.134478
本文采用液相色谱-串联质谱（LC-MS/MS）技术，系统研究了聚苯乙烯纳米塑料（PS-NPs）对斑马鱼幼虫肠道健康和糖脂代谢的影响。研究发现，PS-NPs主要富集于斑马鱼幼虫肠道，引发肠道结构损伤、氧化应激和炎症反应。此外，PS-NPs显著扰乱了肠道菌群组成，并影响了糖脂代谢相关代谢物，尤其是糖酵解/糖异生和甘油酯代谢通路。通过整合组织病理学、微生物组和代谢组分析，研究揭示了PS-NPs通过干扰肠道菌群与代谢物的相互作用，进而导致代谢紊乱的潜在机制。该研究为深入理解纳米塑料对水生生物及人类健康的毒性效应提供了重要科学依据。
质谱生信分析图
总结
通过上述文章可以看出，蛋白组学技术已成为现代生物医学研究不可或缺的重要工具。它能够全面、系统地解析生物体内蛋白质的表达、修饰、相互作用及其功能，从而揭示疾病发生发展中的关键蛋白质变化，为生物标志物的发现、药物靶点的鉴定以及疾病机制的深入解析提供重要信息。近年来，随着技术的飞速发展，蛋白组学在精准医学、药物开发和个性化治疗中的应用日益广泛，尤其在癌症、神经退行性疾病和代谢性疾病等领域取得了突破性进展，相关研究成果频繁发表于《Cell》等顶级学术期刊，彰显了其在生命科学领域的核心地位。
作为临床科研服务与成果转化的引领者，谱度众合致力于为科研工作者提供全方位的蛋白组学解决方案。我们推出了一系列创新产品，包括IP-MS蛋白互作组学解决方案、AP-MS蛋白互作组学解决方案、LiP-MS药物靶点筛选解决方案以及针对生物标志物的一站式研究服务等。此外，我们还针对不同研究场景开发了多种定制化服务产品，旨在满足从基础研究到论文发表的全方位需求，助力科研工作者更高效、更轻松地实现科研目标。
谱度众合始终坚持以创新为核心驱动力，持续输出高品质的产品与服务，全力支持医学工作者的基础科研与临床转化需求。在新的一年里，我们期待与您携手合作，共同推动行业发展与医学进步，为人类健康事业贡献力量！
