服务案例Nat Immunol(IF=27.6)| Pull down-MS助力发现NK细胞新型检查点CLEC12B配体,开辟实体瘤免疫治疗新赛道
所属分类: 技术干货
发布时间: 2026-05-04
概要: 该研究团队聚焦于肝细胞癌(HCC)中自然杀伤(NK)细胞在肿瘤微环境(TME)中出现的进行性功能障碍,首次发现C型凝集素受体CLEC12B是一个限制NK细胞抗肿瘤免疫的全新抑制性检查点。

期刊名称:Nature Immunology
发表时间:2026年3月
影响因子:27.6
期刊分区:JCR 1区/中科院 1区
服务单位:安徽省立医院
服务产品:Pull down-MS蛋白互作组学研究解决方案
服务团队:王雅杰、张庚、李倩
样本类型:肝细胞癌(HCC)临床样本、肿瘤细胞系、C57BL/6J小鼠、Clec12b敲除小鼠、人源化NSG小鼠等
其他信息:单细胞RNA测序、质谱流式(CyTOF)、表面等离子体共振(SPR)
今天为大家解读一项发表于免疫学顶级期刊Nature Immunology的重磅研究,标题为“Targeting NK cell CLEC12B enhances cancer immunotherapy”。该研究团队聚焦于肝细胞癌(HCC)中自然杀伤(NK)细胞在肿瘤微环境(TME)中出现的进行性功能障碍,首次发现C型凝集素受体CLEC12B是一个限制NK细胞抗肿瘤免疫的全新抑制性检查点。
本研究由安徽省立医院孙鹏团队主导完成,谱度众合在分子机制解码环节提供的Pull down-MS蛋白互作组学研究解决方案成功确证:CLEC12B的内源性功能配体为脂蛋白脂肪酶(LPL)。这一关键发现为后续阐明肿瘤细胞如何通过LPL-CLEC12B轴触发抑制性信号、导致NK细胞耗竭提供了直接证据。基于此,团队开发了一种高亲和力纳米抗体(H6-Fc),成功逆转了NK细胞的功能障碍,为实体瘤免疫治疗开辟了极具潜力的新策略。

自然杀伤(NK)细胞是先天免疫系统的核心效应细胞,无需抗原预致敏即可快速识别并杀伤肿瘤细胞,被誉为抗肿瘤免疫的“第一道防线”。然而,在肿瘤微环境(TME)中,NK细胞会逐渐发生功能耗竭,表现为细胞毒性下降、细胞因子分泌减少,这已成为限制免疫治疗疗效的关键瓶颈。
C型凝集素受体家族是调控免疫细胞功能的重要分子群。该家族中既有激活型受体(如NKG2D),也包含携带免疫受体酪氨酸抑制基序(ITIM)的抑制型受体。CLEC12B作为该家族的一员,此前研究仅关注其在髓系细胞中的功能;而它在NK细胞中的表达调控、生物学作用以及对应的内源性配体,此前完全未知。这一认知空白严重阻碍了基于NK细胞的免疫治疗策略开发。
本研究采用“临床多组学分析-靶点配体确证-纳米抗体开发-体内联合免疫治疗”的系统性范式:
❶ 临床与单细胞转录组分析:利用单细胞RNA测序(scRNA-seq)和质谱流式(CyTOF),分析HCC患者肿瘤浸润免疫细胞,锁定在NK细胞中特异性高表达的CLEC12B,并揭示其与患者不良预后的相关性。
❷ 靶点配体筛选与机制确证:利用谱度众合提供的Pull down-MS技术,以CLEC12B-Fc融合蛋白为诱饵,高通量筛选并确证肿瘤细胞表面的LPL为其直接结合配体。随后结合表面等离子体共振(SPR)和免疫印迹实验,系统阐明了LPL-CLEC12B相互作用如何阻断NK细胞杀伤信号通路。
❸ 治疗性纳米抗体开发:建立羊驼免疫噬菌体展示文库,筛选并工程化改造出具有极高亲和力、且去除Fc受体介导效应的靶向纳米抗体(H6-Fc)。
❹ 体内抗肿瘤转化评估:在多种鼠源皮下肿瘤模型(如Hepa1-6、MC38)、转移模型以及人源化NSG小鼠模型中,系统评估了CLEC12B基因敲除及H6-Fc纳米抗体单药或联合PD-1阻断的治疗效果。
(1)CLEC12B是肿瘤浸润NK细胞特异性高表达抑制性检查点,靶向敲除可强效逆转免疫耗竭
研究团队通过对189例肝细胞癌(HCC)患者样本进行单细胞RNA测序(scRNA-seq)发现,CLEC12B超过95%限制性表达于CD45+免疫细胞中。进一步对789例患者大队列转录组数据分析显示,免疫细胞中CLEC12B高表达与患者总生存期(OS)显著变差相关,而肿瘤细胞自身的CLEC12B表达水平与预后无关,提示该分子主要在免疫细胞中发挥促癌作用。
此外,肿瘤微环境可特异性诱导NK细胞CLEC12B上调与功能衰竭:质谱流式(CyTOF)与流式细胞术结果表明,CLEC12B在肿瘤微环境中特异性高表达于肿瘤浸润NK细胞,在巨噬细胞和中性粒细胞中无明显异常。高表达CLEC12B的NK细胞毒性通路下调,且与TIGIT、PD-1、TIM-3、LAG-3等耗竭受体表达呈显著正相关。值得注意的是,敲除CLEC12B可强效恢复NK细胞的抗肿瘤活性:在Hepa1-6肝癌、MC38结直肠癌、B16-F10黑色素瘤等多种小鼠模型中,全身性敲除或NK细胞特异性敲除CLEC12B均可显著抑制肿瘤生长、减少肺/肝转移并延长生存期。
进一步骨髓与脾脏分析证实,敲除CLEC12B并不影响NK细胞发育、成熟及亚群分布,而是通过解除抑制信号(恢复IFN-γ、颗粒酶B、穿孔素等核心杀伤因子分泌,并上调黏附与迁移相关通路)从而增强NK细胞的抗肿瘤活性。

(2)高亲和力纳米抗体(H6-Fc)的成功开发及其在联合治疗中的强大协同增效
基于明确的靶点价值,团队利用重组hCLEC12B-Fc免疫羊驼,并通过迭代噬菌体展示技术筛选出一款高亲和力(KD=47.1 nM)纳米抗体H6-Fc。该抗体对人源和鼠源CLEC12B均具有交叉结合活性,且不与结构相似的CLEC12A发生非特异性结合。为避免Fc受体介导的潜在副作用,团队前瞻性地引入了Fc片段LALA突变(L234A/L235A)。
体外实验证实,极低浓度的H6-Fc即可显著恢复并增强NK细胞对K562、THP-1等靶细胞的杀伤能力,同时有效促进NK细胞的增殖及效应分子的释放。在活体模型中,H6-Fc不仅作为单药展现出显著的抑瘤与延长生存期作用,更展现出了打破免疫耐受壁垒的协同治疗潜力。在Hepa1-6、H22和MC38实体瘤模型中,H6-Fc联合抗PD-1阻断疗法,成功实现了对先天免疫(NK细胞)和适应性免疫(T细胞)的双重激活,肿瘤消退效果显著优于任一单药。此外,该纳米抗体还能与化疗药物(如帕比司他)在C1498白血病模型中产生强烈的协同增效。

(3)Pull down-MS精准确证LPL-CLEC12B免疫逃逸核心信号轴
为揭示CLEC12B是如何被激活从而导致NK细胞耗竭的,寻找其肿瘤细胞表面的内源性“配体”成为了整个研究必须跨越的机制鸿沟。在这一最具挑战性的环节,谱度众合提供的Pull down-MS互作蛋白定性筛选技术发挥了关键作用:以重组的CLEC12B-Fc融合蛋白为诱饵,在天然HepG2肝癌细胞膜裂解液中实施无偏倚的高通量捕获,从海量背景蛋白中,精准锚定脂蛋白脂肪酶(LPL)为首选功能性配体。基于质谱数据的指引,随后的SPR实验完美验证了LPL与CLEC12B之间存在直接的物理互作,且分子对接与Co-IP进一步证实了该结果。流式与共聚焦显微镜发现,LPL并非游离,而是通过硫酸乙酰肝素蛋白聚糖(HSPGs)牢牢锚定在肿瘤细胞膜表面,为跨细胞识别提供了结构基础。
进一步的机制实验彻底阐明了这套免疫逃逸系统:当肿瘤细胞表面的LPL与NK细胞表面的CLEC12B结合后,触发了依赖于ITIM基序的强烈抑制信号。这导致磷酸酶SHP-1过度磷酸化,进而全面切断了下游的SYK-PI3K-AKT-S6激活网络,最终造成了NK细胞脱颗粒受损及细胞因子分泌的断崖式下跌,从分子源头刻画了NK细胞功能障碍的底层逻辑。

(4)抗CLEC12B在人源化模型中重塑NK细胞功能,展现卓越安全性与泛癌种转化前景
为了评估临床转化价值,研究团队构建了移植有人源NK细胞的免疫缺陷重构小鼠模型(HepG2-hNK-NSG),H6-Fc治疗在该模型中显著缩减了肿瘤负荷并延长了生存期。深度表型分析揭示,H6-Fc能够“重塑”浸润NK细胞的受体图谱 —— 大幅下调TIGIT/NKG2A等抑制性受体,上调NKG2C/NKG2D等激活受体,并使CD16、IFN-γ和颗粒酶B的表达全面升高。
在剂量递增毒理实验中,小鼠未出现任何体重下降,肝酶(AST/ALT)指标维持在健康水平,心肝脾肺肾的组织病理学检测(H&E染色)均未见任何毒性损伤,说明其极佳的药理安全性。最后,基于TCGA数据库的泛癌分析及多中心组织微阵列(TMA)的免疫组化验证证实,除肝癌外,CLEC12B在肾透明细胞癌(KIRC)、甲状腺癌(THCA)及食管癌(ESCA)等多种常见实体瘤中均呈现显著高表达。这一发现从临床维度上确认了靶向CLEC12B作为一种广谱型实体瘤免疫治疗策略的重大临床价值。

本研究首次确立了CLEC12B作为NK细胞特异性抑制性检查点的核心地位,完整阐明了“肿瘤表面LPL结合NK细胞CLEC12B→招募SHP-1→抑制SYK-PI3K-AKT信号→NK细胞功能耗竭”的分子机制。
谱度众合提供的Pull down-MS蛋白互作组学研究解决方案作为整个研究的“源头引擎”,精准鉴定出LPL这一关键配体,为机制解析和药物开发提供了不可或缺的核心证据。基于这一发现开发的抗CLEC12B纳米抗体,不仅单药疗效显著,还能与PD-1抑制剂、化疗药物产生协同作用,为肝癌、肾癌、甲状腺癌等多种实体瘤的免疫治疗提供了全新的靶点和策略,具有重要的临床转化价值。
A1:精准的“肿瘤局部”与“细胞类型”双重限制性表达。传统的免疫检查点(如PD-1/PD-L1)通常在全身外周免疫系统中广泛表达,靶向干预极易引发全身性的免疫相关不良反应。本研究的突破性在于,通过单细胞与高维流式分析,首次证实CLEC12B作为一个精准的“分子开关”,高度特异地在“肿瘤浸润NK细胞”表面发生了显著上调和富集。这种高度的肿瘤微环境(TME)特异性意味着,靶向CLEC12B可以在有效解除肿瘤局部免疫抑制的同时,最大程度地避免对全身周边健康免疫系统的非特异性干扰,为开发更安全的实体瘤靶向药物提供了理想靶标。
A2: 无偏倚组学技术是破译全新的免疫逃逸信号轴的关键。在面对CLEC12B这一配体未知的新型受体时,谱度众合提供的Pull down-MS蛋白互作组学研究解决方案成为了破局的核心工具。研究团队以重组CLEC12B-Fc融合蛋白为诱饵,直接在天然状态的HepG2肝癌细胞膜裂解液中实施了高通量捕获。Pull down-MS技术凭借极高的灵敏度和真实生理状态下的捕获能力,从海量的背景蛋白中精准且直观地将脂蛋白脂肪酶(LPL)“点名”为首选功能配体。如果没有这一组学层面的决定性发现,后续关于“LPL通过HSPGs锚定细胞膜-跨细胞结合CLEC12B-激活SHP-1磷酸酶进而导致NK细胞耗竭”的整套全新分子机制将无从建立。该技术充分展现了在攻坚未知靶点互作网络时的绝对优势。
A3: 高渗透、零脱靶、强协同,展现出广谱实体瘤治疗潜力。本研究创新性地利用羊驼免疫体系开发了靶向CLEC12B的纳米抗体(H6-Fc)。相较于体积庞大的传统全长单抗,H6-Fc纳米抗体体积微小(仅约15kDa~40kDa级别),具有卓越的深层实体瘤组织穿透力。此外,团队通过前瞻性的Fc段LALA工程化突变(L234A/L235A),有效避免了潜在的Fc受体介导的非特异性副反应。在临床前体内模型中,H6-Fc不仅展现出了良好的安全性(高剂量无肝肾毒性),更与抗PD-1疗法(激活T细胞)形成了“先天+适应性”双重免疫协同,肿瘤消退效果显著优于单药。结合泛癌种组织芯片(TMA)证实CLEC12B在多种实体瘤中高表达,H6-Fc展现出较高的通用型临床转化前景。
编者总结
本项研究是NK细胞免疫治疗领域的重要成果,它不仅发现了一个全新的NK细胞特异性检查点CLEC12B,更完整解析了其配体依赖的抑制性机制,并开发出具有临床转化潜力的靶向纳米抗体。
在整个研究过程中,谱度众合的Pull down-MS蛋白互作筛选技术以精准、高效、无偏的特性,攻克了免疫检查点配体发现这一核心难题,将原本可能需要数年的筛选工作缩短至数周,显著加速了研究进程。依托这一坚实的技术支撑,研究团队成功构建了从临床问题到机制解析再到药物开发的完整转化链条,为攻克实体瘤免疫治疗耐药、提升免疫治疗疗效提供了新的方向和希望。
撰写人:李维丽
审核人:程钰兰
参考文献
Sun P, Xu X, Hu B, et al. Targeting NK cell CLEC12B enhances cancer immunotherapy. Nat Immunol. Published online March 17, 2026. doi:10.1038/s41590-026-02471-0
本文由谱度众合“生物标志物发现与药物靶点筛选平台”(该平台被认定为“国家生物产业基地公共服务平台”)完成蛋白质组学检测及分析工作。

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关键词: 服务案例Nat Immunol(IF=27.6)| Pull down-MS助力发现NK细胞新型检查点CLEC12B配体,开辟实体瘤免疫治疗新赛道
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